教育

• Computational and Mathematical Engineering部門斯坦福大學數據科學專
• 研究在Stanford Vision Lab
• 斯坦福大學Computer Science和ICME部門的教學

• Centrale Paris工程課程(ECP 17)
• 在Center for Visual Computing (CVC)實驗室與教授Evangelia I. Zacharaki和Nikos Paragios進行研究

項目

MIT

15.003學習指南
數據科學工具

• • 使用SQL進行數據檢索
• • 使用R，Python進行數據操作和可視化
• • Git，Bash的工程技巧

  PDF 網頁  

斯坦福大學

CS 221的VIP備忘單
人工智能

• • 基於刺激的模型
• • 基於狀態的模型
• • 基於變量的模型
• • 基于逻辑的模型

  PDF 網頁  

CS 229的VIP備忘單
機器學習

• • 有監督和無監督的學習
• • 深度學習
• • 機器學習技巧與竅門
• • 機率，統計，線性代數，微積分學

  PDF 網頁  

CS 230的VIP備忘單
深度學習

• • 卷積神經網絡
• • 遞歸神經網絡
• • 深度學習技巧和竅門

  PDF 網頁  

CME 102的VIP備忘單
常微分方程

• • 一階和二階ODE及其應用
• • 線性代數，微積分學，三角學
• • Matlab技巧

  PDF 網頁  

CME 106的VIP備忘單
概率與統計

• • 關鍵概念
• • 分配表，常見問題
• • Matlab技巧

  PDF 網頁  

出版物

1. EnzyNet: enzyme classification using 3D convolutional neural networks on spatial representation
   A. Amidi, S. Amidi, D. Vlachakis, V. Megalooikonomou, N. Paragios, E. Zacharaki
   PeerJ, 2018
   PDF ・ 計算機代碼 ・ 指南
2. Automatic single- and multi-label enzymatic function prediction by machine learning
   S. Amidi, A. Amidi, D. Vlachakis, N. Paragios, E. Zacharaki
   PeerJ, 2017
   PDF ・ 計算機代碼
3. A machine learning methodology for enzyme functional classification combining structural and protein sequence descriptors
   A. Amidi, S. Amidi, D. Vlachakis, N. Paragios, E. Zacharaki
   International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, 2016
   PDF ・ 計算機代碼